eclipse 日本語文字化け

Windows XP 上で eclipse を使っています。プログラムのコメントを日本語で書いていました。文字コードは Shift JISです。 eclipse をバージョンアップ(3.2(?)→3.2.2)したら今まで書いたソースコードのコメントが全て文字化けしてしまいました！ どうすればよいでしょうか・・・？ かなり困っています。